Un dysfonctionnement lors de la composition de l'échantillon a créé des "trous de sondage". Il manque des exploitations. Le problème n'ayant été découvert qu'à la remontée des premiers résultats, seul un échantillon complémentaire d'environ 500 exploitations a été constitué parmi ces trous. Pour l'enquête 2003, l'échantillon a été rééquilibré par une pondéraion a posteriori. L'échantillon de l'enquête 2005 a été constitué à partir de l'échantillon 2003 renforcé par un tirage complémentaire dans les parties manquantes. Pour une analyse sur 2003 seulement, pas trop de problèmes. Pour une analyse 2000-2007, il est préférable de ne pas retenir 2003.